Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Serpina1cQ00896 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms