Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabpb1Q00420 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabpb1Q00420 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms