Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn1bP97952 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scn1bP97952 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms