Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arf1P84078 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf1P84078 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arf1P84078 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf1P84078 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arf1P84078 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms