Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ldb1P70662 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ldb1P70662 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms