Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dlx4P70436 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms