Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2bP67871 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2bP67871 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csnk2bP67871 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csnk2bP67871 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2bP67871 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2bP67871 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2bP67871 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms