Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Uba52P62984 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms