Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ActbP60710 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ActbP60710 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ActbP60710 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ActbP60710 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ActbP60710 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ActbP60710 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ActbP60710 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ActbP60710 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms