Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rims4P60191 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rims4P60191 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms