Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pcif1P59114 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pcif1P59114 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pcif1P59114 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms