Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samsn1P57725 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms