Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PitpnbP53811 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PitpnbP53811 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms