Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prox1P48437 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prox1P48437 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms