Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtgirP43252 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtgirP43252 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtgirP43252 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms