Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp9P41245 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp9P41245 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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