Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hes1P35428 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes1P35428 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes1P35428 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes1P35428 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hes1P35428 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms