Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stfa1P35175 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms