Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms