Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms