Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Casp2P29594 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Casp2P29594 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms