Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HexaP29416 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HexaP29416 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HexaP29416 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HexaP29416 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HexaP29416 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HexaP29416 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HexaP29416 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HexaP29416 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HexaP29416 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HexaP29416 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HexaP29416 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HexaP29416 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HexaP29416 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HexaP29416 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms