Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BgnP28653 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BgnP28653 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BgnP28653 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BgnP28653 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BgnP28653 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BgnP28653 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BgnP28653 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BgnP28653 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BgnP28653 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BgnP28653 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BgnP28653 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BgnP28653 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BgnP28653 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BgnP28653 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BgnP28653 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BgnP28653 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BgnP28653 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BgnP28653 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BgnP28653 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BgnP28653 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BgnP28653 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BgnP28653 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BgnP28653 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BgnP28653 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BgnP28653 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BgnP28653 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms