Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NdnP25233 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NdnP25233 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NdnP25233 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NdnP25233 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NdnP25233 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NdnP25233 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NdnP25233 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NdnP25233 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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NdnP25233 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NdnP25233 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NdnP25233 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NdnP25233 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NdnP25233 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NdnP25233 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NdnP25233 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NdnP25233 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NdnP25233 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NdnP25233 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NdnP25233 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NdnP25233 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NdnP25233 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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