Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsta3P23591 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tsta3P23591 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsta3P23591 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsta3P23591 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsta3P23591 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tsta3P23591 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tsta3P23591 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms