Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ggta1P23336 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms