Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX1P22670 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX1P22670 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX1P22670 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX1P22670 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX1P22670 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX1P22670 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms