Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Klra1P20937 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klra1P20937 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klra1P20937 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klra1P20937 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klra1P20937 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms