Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb9P20615 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb9P20615 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms