Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18530 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18530 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18530 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18530 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18530 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms