Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra6P16305 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms