Protein–RNA interactions for Protein: P15530

Cd79b, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd79bP15530 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms