Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnni2P13412 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnni2P13412 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms