Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp1P11103 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp1P11103 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp1P11103 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp1P11103 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms