Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxb4P10284 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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