Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl2P10148 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms