Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc9P09633 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc9P09633 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc9P09633 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms