Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa1P09022 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms