Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOP08100 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOP08100 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOP08100 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOP08100 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOP08100 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOP08100 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RHOP08100 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOP08100 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOP08100 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms