Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gh1P06880 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gh1P06880 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gh1P06880 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gh1P06880 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gh1P06880 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gh1P06880 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gh1P06880 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gh1P06880 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms