Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01673 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01673 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01673 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01673 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01673 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01673 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01673 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01673 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01673 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01673 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01673 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01673 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01673 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01673 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01673 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01673 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms