Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nid2O88322 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nid2O88322 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms