Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3aO70157 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top3aO70157 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Top3aO70157 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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