Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngr2O55101 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngr2O55101 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngr2O55101 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngr2O55101 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Syngr2O55101 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngr2O55101 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Syngr2O55101 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syngr2O55101 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms