Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole2O54956 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole2O54956 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pole2O54956 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms