Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm2056J3QQ02 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm2056J3QQ02 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm2056J3QQ02 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms