Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm20828J3KMI7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm20828J3KMI7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20828J3KMI7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20828J3KMI7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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