Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcc4E9Q236 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Abcc4E9Q236 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms