Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc171E9Q1U1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
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