Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp4E9PYK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms